Die Gedenkstätte sammelt Dokumente, Bilder, Karten und Bücher zur Geschichte der Mauer. Die Bibliothek und die Sammlungen befinden sich noch im Aufbau. Das systematische Sammeln von Objekten gehört nicht zum Sammlungskonzept der Gedenkstätte.
Bibliothek
Bei der Bibliothek der Gedenkstätte, die gegenwärtig über ca. 1.300 Bände und 600 Medieneinheiten verfügt, handelt es sich um eine Dienstbibliothek für die Mitarbeiter. Sie steht externen Nutzern in der Regel nicht zur Verfügung. Nach Anmeldung und Absprache kann sie jedoch in besonderen Fällen für Forscher und Journalisten zugänglich gemacht werden.
Forschungsarchiv
Im Forschungsarchiv der Gedenkstätte werden die Ergebnisse von Archivrecherchen für die Mitarbeiter der Gedenkstätte zur Verfügung gestellt. Hierbei handelt es sich vornehmlich um Kopien aus staatlichen Archiven, die nicht an Dritte weitergegeben werden dürfen. Darüber hinaus gibt es eine kleine Sammlung von historischen Dokumenten, die die Gedenkstätte selbst zusammengetragen hat.
Bildarchiv
Das digitale Bildarchiv der Gedenkstätte umfasst etwa 8.000 Fotos, zumeist mit Mauer-Motiven. Leider besitzt die Gedenkstätte bei den meisten Bildern nicht die Rechte, weshalb sie nicht an Dritte weitergegeben werden dürfen. Jedoch unterstützt die Gedenkstätte Journalisten und Forscher bei ihrer Bildrecherche. Nach Umbau des Dokumentationszentrums soll im Bildarchiv vor Ort recherchiert werden können.
Kartensammlung
Die Kartensammlung der Gedenkstätte umfasst etwa 300 Karten, darunter ein vollständiger Satz topographischer Karten von Berlin mit Einzeichnung der Grenzanlagen 1981 im Maßstab 1:5.000, die für die Grenztruppen angefertigt worden sind. Bei den meisten anderen Karten handelt es sich um Kopien aus staatlichen Archiven, die nicht an Dritte weitergegeben werden dürfen.

